Факультеты

• Факультет кыргызской филологии и журналистики
• Факультет русской филологии
• Факультет мировых языков и культур
• Факультет искусств
• Факультет востоковедения и истории
• Юридический факультет
• Факультет естествознания, туризма и аграрных технологий
• Факультет математики и информационных технологий
• Физико-технический факультет
• Факультет бизнеса и менеджмента
• Факультет международных отношений
• Кыргызско-Китайский факультет
• Медицинский факультет
• Теологический факультет
• Международный медицинский факультет
• Высшая школа международных образовательных программ
• Факультет физического воспитания
• Факультет педагогики и психологии

Колледжи

• Колледж международных образовательных программ
• Медицинский колледж
• Финансово-юридический колледж
• Узгенский международный медицинский колледж
• Инновационный колледж STEM
• Индустриально-педагогический колледж

Институты

• Гуманитарный институт "Арашан"
• Институт повышения квалификации учителей, школы и центр довузовской подготовки
• Институт повышения квалификации ОшГУ

Лицеи и гимназии

• Лицей "Билим"
• Лицей "Ыйман"
• Карасуйская гимназия
• Ноокатская гимназия
• Кара-Кульджинская гимназия
• Центр начального образования "Зирек"
• Профессиональный лицей №12

Департаменты

• Учебно-информационный департамент
• Департамент аккредитации и качества образования
• Департамент магистратуры и PhD докторантуры)
• Департамент международных связей
• Департамент административно-хозяйственного обеспечения
• Департамент информационных технологий и технического обеспечения

Центры

• Академия Талантов
• Фонд имени Р.Абдыкадырова
• Центр последипломного и непрерывного медицинского образования