Кафедра «Бухгалтерский учет и экономический анализ» образована в 2000 году Приказом ректора Ошского государственного университета № 6/1-10 от 18 мая 2000года, с целью подготовки высококвалифицированных специалистов по специальности Г 16.305 «Бухгалтерский учет, анализ и аудит».
С усилением рыночных отношений и принятием Международных стандартов бухгалтерского учета (МСБУ) в Республике происходил изменение системы бухгалтерского учета. В связи с этим в первую очередь большое внимание уделялась подготовку специалистов в соответствии с требованием МСБУ.
За короткий срок кафедрой осуществлена разработка нового учебного плана и проведена дальнейшая специализация по двум направлением «Бухгалтерский учет, анализ и аудит»». Впервые на Юге Кыргызской Республики выпуск студентов по данной специальности осуществлен в 2004 году.
Кафедрой был подготовлен новый учебный план. Преподаватели кафедры прошли курсы и получили сертификаты дающие право на профессиональную деятельность по МСБУ, организованной Международным агентством ЮСАИД (корпорации «КАРАНА», «ПРАГМА»). В результате участия преподавателями кафедры в проекте ЮСАИД указанными корпорациями в безвозмездной основе переданы в библиотеку кафедры учебники и учебные пособие на общую сумму более 183 000 сомов. Ежегодно преподаватели участвовали в летних школах международных организациях.
В настоящее время кафедра «Бухгалтерский учет и экономический анализ» является одной из ведущих кафедр факультета «БиМ». По итогам проведенного анализа кафедра «Бухгалтерский учет и экономический анализ» является одной из престижных кафедр ОшГУ и держит лидерство среди аналогичных кафедр ВУЗов Юга КР.
Со дня образования кафедры подготовлена более 1000 специалистов, из них трудоустроились и работают по специальности более 60%. Преподавателями кафедры постоянно ведется активная научная работа в рамках хоздоговорных тем. Результаты выполненных научных исследований регулярно докладываются на научно-практических конференциях, конгрессах, форумах различного уровня, в том числе и в международных, публикуются в печати и используются в учебном процессе.