Миссия университета:

- обеспечение гарантии качества в современном учебном процессе через компетентностное отношение;

- интеграция в мировое пространство образования, науки и культуры;

- формирование у молодежи нравственных, культурных и научных ценностей, национальной духовной культуры;

- подготовка высококвалифицированных профессиональных кадров, способных реализовать свой интеллектуальный потенциал в производстве и профессиональной деятельности в целях обеспечения развития экономического, социального, культурного, политического развития государства.

Перспективные цели университета – трансформация ОшГУ из классического университета в исследовательский и инновационный университет мирового уровня.

Стратеги ческая цель - вхождение в ТОП-700 передовых исследовательских университетов мира. Превращение ОшГУ в один из трех лучших университетов Центральной Азии.